26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3257 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  25.81 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.51 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00236335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  26.83 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  30.26 
 
 		 459 aa  62.4  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 994 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.87 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  24.56 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  26.58 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  24.9 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  29.1 
 
 		 335 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.65 
 
 		 941 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 		 492 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.85 
 
 		 663 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1535  hypothetical protein  28.47 
 
 		 225 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.771018  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  25.69 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2443  putative chemotaxis transducer  26.97 
 
 		 531 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28050  putative chemotaxis transducer  27.15 
 
 		 531 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.652078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  30.06 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3270  CheA signal transduction histidine kinases  30.26 
 
 		 712 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.308158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3050  PAS sensor protein  29.13 
 
 		 653 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2785  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.62 
 
 		 648 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 603 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  24.84 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2058  histidine kinase  25.95 
 
 		 499 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.66 
 
 		 383 aa  42.7  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>