23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1426 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  100 
 
 		 259 aa  534  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  54.33 
 
 		 268 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  36.32 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  33.89 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  31.05 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  29.02 
 
 		 280 aa  85.5  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  29.28 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  28.45 
 
 		 495 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.32 
 
 		 492 aa  79  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  29.96 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  32.18 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  28.1 
 
 		 295 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.94 
 
 		 430 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.15 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  26.58 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  24.65 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  24.22 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  28.33 
 
 		 459 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1513  hypothetical protein  31.01 
 
 		 335 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000253198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  28.06 
 
 		 426 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.65 
 
 		 700 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.96 
 
 		 531 aa  42.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>