21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0623 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  54.33 
 
 		 259 aa  278  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  31.35 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  28.63 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  32.24 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.87 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  25.56 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  25.56 
 
 		 285 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  26.05 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  33.54 
 
 		 495 aa  67  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  24.24 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0649  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.2 
 
 		 492 aa  62  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0711  hypothetical protein  29.72 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00036946  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  25.82 
 
 		 430 aa  50.8  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  26.26 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3257  hypothetical protein  24.84 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  31.88 
 
 		 426 aa  42.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.22 
 
 		 531 aa  42.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>