16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1861 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1861  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000583008  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3326  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000106797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  28.07 
 
 		 259 aa  99  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  29.24 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  27.31 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  27.31 
 
 		 280 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  27.71 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  27 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.21 
 
 		 430 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  25.11 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  30.89 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.28 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1426  IMP dehydrogenase  24.22 
 
 		 259 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0623  hypothetical protein  26.26 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  24.7 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  24.57 
 
 		 495 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>