184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2314 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2314  response regulator  100 
 
 		 426 aa  823    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3275  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.39 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2675  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.51 
 
 		 383 aa  341  1e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3525  ANTAR domain protein with unknown sensor  40.96 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1393  putative response regulator transcription regulator protein  36.31 
 
 		 210 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.84 
 
 		 198 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1340  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.76 
 
 		 198 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.579049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3858  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.84 
 
 		 219 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.853052  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.3 
 
 		 198 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.84 
 
 		 219 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3167  hypothetical protein  35.98 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.672068  normal  0.448822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4403  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.3 
 
 		 198 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1167  response regulator NasT  35.91 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.136185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1090  response regulator NasT  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0864919  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0246  response regulator NasT  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0087  response regulator/ANTAR domain-containing protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.792302  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0333  response regulator NasT  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169956  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1759  response regulator/ANTAR domain-containing protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1670  response regulator/ANTAR domain-containing protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1255  response regulator/ANTAR domain-containing protein  36.26 
 
 		 198 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0422038  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4144  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.96 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.071014 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0829  response regulator receiver:ANTAR  30.85 
 
 		 191 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.018256 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3445  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.69 
 
 		 191 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.69 
 
 		 191 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1415  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.1 
 
 		 210 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.609776  normal  0.778661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1968  hypothetical protein  34.31 
 
 		 280 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3168  hypothetical protein  34.89 
 
 		 290 aa  97.1  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.307206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1750  hypothetical protein  34.31 
 
 		 285 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.88 
 
 		 207 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.59 
 
 		 196 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3266  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.49 
 
 		 210 aa  94.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.559806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.62 
 
 		 191 aa  94.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.17 
 
 		 195 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0382  response regulator transcription regulator protein  31.38 
 
 		 195 aa  93.6  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.846144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.43 
 
 		 196 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.76 
 
 		 206 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.76 
 
 		 206 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  30.94 
 
 		 191 aa  90.1  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2589  Fis family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 208 aa  89.7  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488842 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  34.87 
 
 		 192 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  34.87 
 
 		 192 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1661  transcription antitermination regulatory protein  33.68 
 
 		 194 aa  89.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1611  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.53 
 
 		 191 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.07 
 
 		 195 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23450  response regulator NasT  31.96 
 
 		 192 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.212044  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0278  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.45 
 
 		 219 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.93 
 
 		 197 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  32.07 
 
 		 195 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3038  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.04 
 
 		 206 aa  87.4  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.25 
 
 		 196 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.14 
 
 		 221 aa  87  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3317  putative response regulator NasT  25.81 
 
 		 201 aa  87  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0234612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2553  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.65 
 
 		 215 aa  87  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2581  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.21 
 
 		 192 aa  87  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.298585  hitchhiker  0.00648362 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0769  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.73 
 
 		 214 aa  86.3  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0679202  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.93 
 
 		 208 aa  86.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0331  response regulator receiver:ANTAR  31.38 
 
 		 214 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2306  response regulator NasT  32.64 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1604  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.47 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0238  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.57 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0259  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.57 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.32 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1784  response regulator receiver  30.11 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1086  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.95 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2104  response regulator receiver:ANTAR  31.94 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2093  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.95 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal  0.0833699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3647  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.95 
 
 		 191 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.1 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.77 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3741  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.17 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.755024  normal  0.109153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3809  hypothetical protein  29.05 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2871  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.47 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372726  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  30.77 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  31.95 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1211  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.33 
 
 		 194 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.51 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 		 195 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4227  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.57 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0711042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.3 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2732  hypothetical protein  31.78 
 
 		 303 aa  77.4  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  32.12 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3322  cyclic nucleotide-binding  31.51 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000319874 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4455  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.269789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3277  hypothetical protein  32.99 
 
 		 259 aa  75.9  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.52 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.3 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.79 
 
 		 196 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2271  response regulator receiver domain-containing protein  31.16 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.187486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2959  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.05 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1703  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.27 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  30.91 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1762  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.08 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.0125916 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1406  hypothetical protein  33.77 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.561987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.23 
 
 		 229 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.48 
 
 		 196 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  29.53 
 
 		 194 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  30.3 
 
 		 204 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.99 
 
 		 194 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1262  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.49 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.425993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>