More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5031 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4863  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.49 
 
 		 686 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0070905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4989  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.34 
 
 		 686 aa  1016    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  63.11 
 
 		 691 aa  763    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5031  type IV pilus biogenesis protein PilJ  100 
 
 		 680 aa  1353    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0491  chemotaxis sensory transducer  98.09 
 
 		 680 aa  1326    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0475  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  79.94 
 
 		 686 aa  1035    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.178091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0511  twitching motility protein PilJ  77.44 
 
 		 682 aa  1002    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.34 
 
 		 686 aa  1015    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5305  chemotaxis sensory transducer  82.02 
 
 		 686 aa  1092    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115158  normal  0.281343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  78.05 
 
 		 678 aa  1012    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3631  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.25 
 
 		 731 aa  686    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.455048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05360  twitching motility protein PilJ  77.59 
 
 		 682 aa  1004    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2901  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.65 
 
 		 700 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.726182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01605  pilus biogenesis protein  47.55 
 
 		 678 aa  526  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.128934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 		 686 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.688228 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.59 
 
 		 678 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 		 680 aa  474  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1019  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 		 680 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.58121  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  68.25 
 
 		 473 aa  445  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0517  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.29 
 
 		 671 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.104858  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1815  putative chemotaxis sensory transducer  64.62 
 
 		 475 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0128  chemotaxis sensory transducer  60.45 
 
 		 537 aa  424  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.9 
 
 		 745 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 		 745 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.37 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  40.79 
 
 		 743 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3896  chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 706 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  38.93 
 
 		 707 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 733 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.02 
 
 		 733 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371682  normal  0.522662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.42 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0237962  normal  0.734928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.76 
 
 		 745 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3018  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  0.701163 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2898  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.47 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0204496  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3351  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 		 759 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.335724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.47 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946853  normal  0.162427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.37 
 
 		 692 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.534971 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.18 
 
 		 759 aa  364  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.43954  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 		 770 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408638  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.34 
 
 		 543 aa  354  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 		 749 aa  353  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.66 
 
 		 745 aa  349  1e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.484204  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 		 777 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0103685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.98 
 
 		 704 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.02239  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1015  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 		 839 aa  239  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0741142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3745  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 852 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.75 
 
 		 1153 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.75 
 
 		 1153 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0506  chemotaxis sensory transducer  38.26 
 
 		 982 aa  219  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.202983  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 975 aa  218  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  39.27 
 
 		 902 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4746  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 		 503 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 915 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 880 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0720  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.06 
 
 		 880 aa  206  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  38.15 
 
 		 879 aa  200  9e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.698769  hitchhiker  0.00000570114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.53 
 
 		 1105 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.610597  normal  0.482443 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 		 533 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 		 787 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.68627  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.39 
 
 		 570 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.93 
 
 		 550 aa  194  4e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with phytochrome sensor  35.56 
 
 		 1406 aa  194  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0185965  normal  0.079214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 544 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.76 
 
 		 778 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.16 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 		 542 aa  192  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  36.87 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 543 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.01 
 
 		 541 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 540 aa  187  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 628 aa  187  5e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  35.17 
 
 		 544 aa  187  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  38.39 
 
 		 549 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0061  chemotaxis sensory transducer  35.67 
 
 		 752 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.691552  normal  0.30416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.41 
 
 		 768 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541717  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.25 
 
 		 539 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.87 
 
 		 547 aa  184  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 1079 aa  182  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.15 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 		 532 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.5 
 
 		 661 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.29 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.85 
 
 		 533 aa  180  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.2 
 
 		 539 aa  180  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  37.14 
 
 		 541 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 547 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0520  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.09 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 549 aa  177  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 540 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3778  chemotaxis sensory transducer, phytochrome sensor  33.85 
 
 		 1100 aa  177  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.4 
 
 		 601 aa  177  6e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 820 aa  177  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.14 
 
 		 540 aa  176  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  37.29 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4287  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 854 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>