More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1643 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
227 aa  454  1e-127  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 
226 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.35 
 
 
227 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
228 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.7 
 
 
231 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.07 
 
 
227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.96 
 
 
236 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
248 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
228 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
219 aa  118  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.7 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
237 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.57 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.44 
 
 
229 aa  113  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.38 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.4 
 
 
229 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
226 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
230 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.44 
 
 
243 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
224 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.72 
 
 
243 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
227 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
249 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
227 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
252 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
227 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.306356 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
231 aa  102  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
231 aa  102  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
227 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
262 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
241 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
218 aa  102  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  33.18 
 
 
225 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.82 
 
 
231 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 
224 aa  101  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
226 aa  102  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
231 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.66 
 
 
225 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 
225 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 
225 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
255 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
232 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1297  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.33 
 
 
222 aa  98.2  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1785  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0232074  normal  0.813169 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
241 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2109  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170093  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
229 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.83 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 
224 aa  95.5  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
253 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
232 aa  95.1  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.45 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
254 aa  94.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2884  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.161359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 
231 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.92 
 
 
225 aa  94  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  27.05 
 
 
221 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  32.12 
 
 
235 aa  94  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.07 
 
 
243 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  34.58 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  34.58 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  29.65 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  29.65 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
239 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  34.58 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.02 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.29 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0390  cyclic nucleotide-binding protein  27.5 
 
 
218 aa  92  7e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000226333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
223 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 
253 aa  91.7  8e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2685  cAMP-binding protein  27.83 
 
 
272 aa  91.7  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.62 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  31.63 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.31 
 
 
224 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  31.02 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.15 
 
 
244 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  31.16 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>