More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2074 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
225 aa  443  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  72.44 
 
 
225 aa  335  2.9999999999999997e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.31 
 
 
219 aa  145  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.74 
 
 
225 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.54 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.43 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.65 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.01 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.97 
 
 
225 aa  128  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.6 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.22 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  39.17 
 
 
224 aa  126  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  38.18 
 
 
225 aa  125  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.03 
 
 
228 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  35.29 
 
 
225 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
242 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  38.71 
 
 
228 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  122  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
224 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.21 
 
 
220 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  35.45 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  36.11 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.79 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  36.28 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.21 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.89 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  40.96 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.09 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  36.49 
 
 
225 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.67 
 
 
220 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
226 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.64 
 
 
232 aa  111  8.000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.03 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.92 
 
 
224 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
224 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
234 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.22 
 
 
224 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
225 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.35 
 
 
218 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.25 
 
 
226 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.41 
 
 
231 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
225 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  36.87 
 
 
225 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
228 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
236 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
225 aa  105  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
222 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
225 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
238 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.16 
 
 
229 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 
236 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  34.1 
 
 
222 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
226 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.21 
 
 
232 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
222 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
227 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
248 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
225 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
252 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.5 
 
 
251 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.09 
 
 
226 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 
235 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.63 
 
 
229 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.93 
 
 
225 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
228 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
231 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.64 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  36 
 
 
241 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
235 aa  98.6  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.99 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 
235 aa  98.2  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
230 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.03 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  32.09 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.57 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
246 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
250 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  27.49 
 
 
267 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  32.78 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
228 aa  94.7  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2833  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.96 
 
 
213 aa  94.7  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0320601  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>