More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0465 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
223 aa  438  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.15 
 
 
219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  48.33 
 
 
212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  44.5 
 
 
213 aa  189  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  42.36 
 
 
212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  41.35 
 
 
214 aa  169  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
209 aa  128  6e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  36.79 
 
 
200 aa  123  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  33.5 
 
 
213 aa  122  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 
229 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
248 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  35.2 
 
 
198 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
227 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
227 aa  111  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 
201 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.38 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 
227 aa  109  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  34.69 
 
 
198 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.96 
 
 
226 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.56 
 
 
228 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
228 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
243 aa  105  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
231 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
236 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
229 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.13 
 
 
241 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.19 
 
 
226 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
227 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
226 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.22 
 
 
225 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.78 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
229 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.46 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 
231 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.28 
 
 
225 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.1 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  29.27 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  25.33 
 
 
225 aa  95.9  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
222 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  26.51 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.75 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
236 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
236 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
237 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  24 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
236 aa  91.7  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
229 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
230 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.56 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  26.03 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
254 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.87 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  28.64 
 
 
236 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  26.15 
 
 
254 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.1 
 
 
224 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
226 aa  87  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
227 aa  87.4  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
234 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.67 
 
 
229 aa  86.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  22.27 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
229 aa  85.5  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
225 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
230 aa  85.1  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.19 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  29.19 
 
 
229 aa  85.1  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
231 aa  85.1  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
224 aa  84.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4660  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3583  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>