50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1296 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  50.24 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  40.57 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  31.43 
 
 		 212 aa  108  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  32.82 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  31.98 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  29.84 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  31.58 
 
 		 213 aa  98.6  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.41 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  26.67 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  28.29 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 198 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.72 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.81 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.36 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 		 229 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.63 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.36 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2568  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.13 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.560798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2978  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.66 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.8 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 		 248 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 229 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  21.63 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  23.15 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2229  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.61 
 
 		 258 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.97 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 		 403 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1392  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639788  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.48 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2622  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.43 
 
 		 218 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2526  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.43 
 
 		 218 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1333  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.43 
 
 		 218 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.36 
 
 		 229 aa  42  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 227 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.12 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.75 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>