213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1512 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  50.24 
 
 
218 aa  206  2e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  44.81 
 
 
221 aa  185  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 
219 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  34 
 
 
213 aa  106  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  31 
 
 
212 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  27.32 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  29.56 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  30 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  26.98 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 
198 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.87 
 
 
236 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  27.6 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.79 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.58 
 
 
222 aa  66.2  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.87 
 
 
225 aa  62  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
230 aa  61.6  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.91 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.27 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
228 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
225 aa  58.2  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
230 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  15.35 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  24.52 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.1 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.66 
 
 
227 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.36 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.94 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.64 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3995  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0432337  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.04 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.22 
 
 
257 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.46 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.46 
 
 
246 aa  55.1  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  25.45 
 
 
244 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.22 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.76 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.69 
 
 
238 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  21.84 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
235 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  18.22 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5927  cyclic nucleotide-binding protein  22.84 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.01 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.45 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1580  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
229 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.28 
 
 
254 aa  52  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.48 
 
 
231 aa  51.6  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.07 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.55 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  16.82 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.83 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.64 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.4 
 
 
233 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.38 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  20.45 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.05 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.62 
 
 
219 aa  50.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  21.84 
 
 
232 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.09 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  16.89 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
227 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  21.84 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.82 
 
 
223 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  16.67 
 
 
230 aa  49.3  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1428  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
230 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.6 
 
 
262 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.52 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.78 
 
 
229 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.35 
 
 
224 aa  48.9  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  17.98 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.21 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.78 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1392  cyclic nucleotide-binding protein  26.63 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639788  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2622  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.13 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2526  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.13 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1333  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.13 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.36 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  16.36 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  23.61 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>