More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0710 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  44.81 
 
 
221 aa  185  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
218 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
219 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  29.72 
 
 
212 aa  101  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  29.95 
 
 
212 aa  101  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  31.31 
 
 
214 aa  99  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  29.95 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.04 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
222 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.41 
 
 
209 aa  85.5  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.11 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.97 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.39 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.53 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  26.44 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  25.81 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  24.19 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
249 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0060  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4014  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.43 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
224 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
225 aa  61.6  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  25.4 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.5 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.32 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  24.87 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3466  regulator of Biofilm formation Fnr Family  23.53 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.42 
 
 
229 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.93 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
228 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  26.52 
 
 
244 aa  58.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
257 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.71 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
253 aa  57.4  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.66 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
229 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.43 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 
230 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0780  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.91 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.390237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.64 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.11 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.12 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1009  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.89 
 
 
649 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.959275  normal  0.0476299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.07 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4012  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
259 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0525745  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1904  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
254 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0603838  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4101  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.94 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4355  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
259 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5999  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.582695  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.38 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.74 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  20.18 
 
 
223 aa  55.5  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.66 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
231 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.12 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.66 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  23.56 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.12 
 
 
227 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.5 
 
 
403 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  24.78 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.88 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1454  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.81 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.71 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  21.92 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5904  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.79 
 
 
257 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.379633  normal  0.222249 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  21.88 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  23.5 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.73 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.03 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>