More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5052 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  72.27 
 
 
230 aa  335  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  71.82 
 
 
230 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
263 aa  157  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
246 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  36.94 
 
 
224 aa  137  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.24 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 
225 aa  132  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  35.59 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 
224 aa  128  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  34.11 
 
 
225 aa  128  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  33.94 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.39 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.53 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
224 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.68 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
224 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.88 
 
 
224 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.92 
 
 
226 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.94 
 
 
228 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.32 
 
 
226 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.08 
 
 
228 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.98 
 
 
224 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.08 
 
 
226 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.88 
 
 
224 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  35.14 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.78 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.8 
 
 
246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.59 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31.73 
 
 
243 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.48 
 
 
225 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
236 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
225 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  29.52 
 
 
236 aa  103  3e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
225 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
226 aa  101  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 
219 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.71 
 
 
236 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
230 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  31.98 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.77 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.84 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.61 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
229 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.32 
 
 
227 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.88 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4308  cyclic nucleotide-binding protein  29.77 
 
 
239 aa  89.4  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0411784  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
226 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
228 aa  89  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
222 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.27 
 
 
226 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.07 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.39 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.7 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  28.96 
 
 
267 aa  86.3  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.11 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.44 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.98 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.61 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  28.29 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.07 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 
222 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>