More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0505 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
224 aa  447  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  93.3 
 
 
224 aa  403  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
224 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  92.41 
 
 
224 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
224 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
224 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.86 
 
 
224 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  90.18 
 
 
224 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  84.82 
 
 
224 aa  358  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  83.04 
 
 
224 aa  356  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.11 
 
 
225 aa  345  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  79.46 
 
 
224 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.07 
 
 
224 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  74.55 
 
 
225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  74.11 
 
 
225 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  72.32 
 
 
225 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  59.64 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.64 
 
 
226 aa  274  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.91 
 
 
220 aa  272  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.01 
 
 
228 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  59.91 
 
 
228 aa  268  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.06 
 
 
225 aa  263  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.04 
 
 
228 aa  263  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.66 
 
 
225 aa  262  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  58.04 
 
 
224 aa  262  3e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.56 
 
 
242 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.21 
 
 
225 aa  260  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  58.3 
 
 
225 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  55.86 
 
 
225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  56.05 
 
 
226 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.3 
 
 
226 aa  255  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  56.44 
 
 
225 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  53.15 
 
 
225 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.7 
 
 
241 aa  245  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.46 
 
 
224 aa  245  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.95 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  60.7 
 
 
246 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  46.22 
 
 
236 aa  203  2e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  45.13 
 
 
239 aa  202  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  35.65 
 
 
243 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
246 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.45 
 
 
263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
230 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.38 
 
 
225 aa  143  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
230 aa  143  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  39.18 
 
 
225 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
252 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.88 
 
 
228 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.12 
 
 
226 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  37.7 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
225 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
226 aa  123  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
226 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
224 aa  121  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  36.27 
 
 
223 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.91 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 
243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.98 
 
 
236 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
223 aa  118  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.44 
 
 
222 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.52 
 
 
220 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.83 
 
 
231 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
223 aa  115  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.31 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
228 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 
222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
239 aa  112  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
236 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 
232 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
241 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
234 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.83 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 
240 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.79 
 
 
243 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.79 
 
 
243 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
248 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
230 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.24 
 
 
229 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.36 
 
 
230 aa  107  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
235 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
227 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
236 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>