More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8981 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 222 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.9 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 223 aa  236  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  56.02 
 
 		 223 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.5 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.65 
 
 		 212 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.58 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.27 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  37.07 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  37.44 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.46 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.61 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  38.28 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.53 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  36.46 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.92 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.98 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  34.12 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  34.54 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.91 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.98 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  35.44 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.58 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.57 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  33.5 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  33.03 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 224 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.83 
 
 		 246 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.73 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 224 aa  104  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.95 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  36.81 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.88 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.32 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  39 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  36.7 
 
 		 231 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 225 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  39 
 
 		 246 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.36 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  33.33 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  34.24 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.52 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 261 aa  98.2  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.55 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.87 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  30.96 
 
 		 222 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  92  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.3 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  91.3  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.36 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.47 
 
 		 240 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.7 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 224 aa  88.6  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  36.46 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 236 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>