279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2683 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.87 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.47 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
225 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.07 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.12 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
231 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
229 aa  73.6  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.76 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
246 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  28.84 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  32.85 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.74 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.33 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  29.44 
 
 
225 aa  65.1  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0259  cyclic nucleotide-binding protein  25.66 
 
 
222 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.99 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.73 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  26.92 
 
 
261 aa  63.2  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.55 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.36 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
226 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.78 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.3 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.71 
 
 
220 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
239 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.39 
 
 
235 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.13 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.28 
 
 
236 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
237 aa  58.9  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
229 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0213  cyclic nucleotide-binding protein  24.78 
 
 
259 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.26 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 
231 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.19 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.1 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.25 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.44 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.63 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  20.72 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.45 
 
 
227 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.83 
 
 
228 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.71 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.5 
 
 
240 aa  56.6  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  23.29 
 
 
200 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
246 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
261 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.96 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
239 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  23.92 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.83 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.83 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
232 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
229 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.07 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.2 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.96 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.851339  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  31.78 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.23 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
228 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2591  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.74 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.44 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.49 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  26.26 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.07 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>