More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0718 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  79.91 
 
 
224 aa  339  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  78.57 
 
 
224 aa  337  9e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  77.23 
 
 
224 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.77 
 
 
225 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  79.46 
 
 
224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  77.23 
 
 
224 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  76.79 
 
 
224 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  76.79 
 
 
224 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  76.79 
 
 
224 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  76.79 
 
 
224 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  77.23 
 
 
224 aa  332  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  70.09 
 
 
224 aa  318  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  72.77 
 
 
225 aa  297  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  72.77 
 
 
225 aa  296  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  63.68 
 
 
226 aa  289  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  61.88 
 
 
226 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  64.86 
 
 
228 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  66.96 
 
 
225 aa  282  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.71 
 
 
228 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.95 
 
 
228 aa  277  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  62.67 
 
 
220 aa  271  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  61.71 
 
 
242 aa  270  9e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  58.04 
 
 
224 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.66 
 
 
225 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  57.21 
 
 
225 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.3 
 
 
225 aa  260  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  58.3 
 
 
225 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  58.3 
 
 
226 aa  256  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.74 
 
 
226 aa  254  5e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  55.86 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.64 
 
 
225 aa  247  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  55.11 
 
 
225 aa  244  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  56.31 
 
 
225 aa  242  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  57.59 
 
 
224 aa  242  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.57 
 
 
241 aa  237  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.14 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  46.22 
 
 
236 aa  208  6e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  43.81 
 
 
239 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  36.67 
 
 
243 aa  148  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
246 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.85 
 
 
225 aa  141  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.6 
 
 
225 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.12 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
230 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
230 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
226 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  38.32 
 
 
225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
227 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.39 
 
 
231 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.56 
 
 
229 aa  124  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.77 
 
 
226 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
226 aa  121  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  37.76 
 
 
223 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
252 aa  118  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
236 aa  118  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
236 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  34.41 
 
 
214 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 
243 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.49 
 
 
236 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.58 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
223 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
236 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
223 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
236 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
251 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 
240 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
247 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.75 
 
 
219 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
225 aa  111  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.41 
 
 
220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.55 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
236 aa  108  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
217 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
234 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
241 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
229 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 
225 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
234 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
236 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
222 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
226 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
222 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 
243 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
230 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.89 
 
 
243 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
250 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>