More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0783 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  48.36 
 
 		 222 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.71 
 
 		 229 aa  218  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.93 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.22 
 
 		 223 aa  185  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.23 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.6 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  35.08 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  33.51 
 
 		 224 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.02 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.86 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 220 aa  103  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.21 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.85 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.51 
 
 		 225 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.73 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.21 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.28 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 		 228 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.38 
 
 		 228 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.68 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 		 224 aa  98.6  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 		 227 aa  98.2  8e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 		 243 aa  98.2  9e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.7 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 254 aa  95.1  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  32.63 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  37.11 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  32.38 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  28.5 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  28.5 
 
 		 232 aa  89.4  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.29 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3114  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 232 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 231 aa  88.2  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.35 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.29 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.53 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 354 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 210 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3348  cyclic nucleotide-binding  29.19 
 
 		 254 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 		 220 aa  85.5  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 254 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>