More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3455 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  488  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  62.34 
 
 
239 aa  318  5e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1499  cyclic nucleotide-binding protein  40.65 
 
 
165 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.191417  normal  0.714483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
236 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 
225 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
226 aa  106  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
225 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.12 
 
 
352 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 
226 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 
226 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
219 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 
227 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
225 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.96 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.03 
 
 
354 aa  94  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.16 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.29 
 
 
220 aa  92  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 
224 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  30.7 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
222 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.9 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
248 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
229 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.54 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.42 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.82 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.67 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.54 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.36 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0257  transcriptional regulator NnrR  23.23 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.89 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.7 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  26.94 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0267635  normal  0.395563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.91 
 
 
232 aa  82.4  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0281  transcriptional regulator NnrR  23.12 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.42 
 
 
222 aa  82  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0394  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.06 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.97 
 
 
225 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.11 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3897  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.280734  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.78 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.43 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  26.88 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  27.23 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  26.76 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  29.05 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  23.96 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.66 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.53 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
226 aa  79  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.54 
 
 
228 aa  79  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.7 
 
 
224 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  26 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.51 
 
 
350 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4447  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
263 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.69 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 
226 aa  77.8  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.05 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
250 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.17 
 
 
226 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25.71 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.51 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
228 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.29 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.12 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.9 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.37 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.94 
 
 
235 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
232 aa  77  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>