More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2678 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
235 aa  474  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  70 
 
 
232 aa  341  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  69.57 
 
 
232 aa  338  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  75.64 
 
 
235 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  75.64 
 
 
235 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.81 
 
 
234 aa  325  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  70.95 
 
 
231 aa  285  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  38.83 
 
 
227 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  37.96 
 
 
227 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.07 
 
 
227 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  36.74 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.04 
 
 
227 aa  150  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  36.57 
 
 
231 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.6 
 
 
231 aa  148  9e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.16 
 
 
231 aa  115  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 
229 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.63 
 
 
229 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
258 aa  112  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 
223 aa  106  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 
225 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  34.09 
 
 
235 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
224 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
225 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.86 
 
 
225 aa  102  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  34.33 
 
 
214 aa  101  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
243 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
225 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.8 
 
 
225 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.38 
 
 
228 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.83 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.15 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.55 
 
 
224 aa  95.1  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 
228 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.09 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 
228 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
223 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
226 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.6 
 
 
223 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
234 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.39 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.11 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  31.48 
 
 
228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.68 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 
225 aa  92  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.15 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.7 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.8 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
226 aa  89  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
228 aa  89  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.35 
 
 
226 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.36 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
230 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.56 
 
 
225 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.48 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  28.71 
 
 
212 aa  85.9  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  34.05 
 
 
228 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  33.85 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.62 
 
 
222 aa  85.1  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4566  cyclic nucleotide-binding protein  34.67 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  34.67 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.91 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.3 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.13 
 
 
238 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.11 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  32.73 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.04 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.84 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  28.93 
 
 
211 aa  82  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.94 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 
231 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.87 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  28.43 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>