More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3066 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  88.79 
 
 		 232 aa  426  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  73.08 
 
 		 234 aa  357  9.999999999999999e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  70 
 
 		 235 aa  314  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  72.85 
 
 		 231 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.81 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.81 
 
 		 235 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  39.59 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  38.1 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.31 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  37.67 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  37.75 
 
 		 237 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  39.01 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.55 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.58 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.34 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  34.34 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.71 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.07 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.18 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 220 aa  99.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.23 
 
 		 225 aa  98.2  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 		 228 aa  95.1  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.63 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.96 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  29.49 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 235 aa  92.8  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  32.86 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  33.63 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  31.03 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.97 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  33.19 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4566  cyclic nucleotide-binding protein  33.19 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.13 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.31 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.84 
 
 		 225 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.38 
 
 		 230 aa  85.1  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.99 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  32.46 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.21 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  27.64 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  28.14 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>