More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1243 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  100 
 
 
231 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
231 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  39.56 
 
 
232 aa  124  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
234 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  36.45 
 
 
231 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
232 aa  121  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.33 
 
 
231 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.5 
 
 
235 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.5 
 
 
235 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.16 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 
237 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.52 
 
 
225 aa  94  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.15 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
223 aa  86.3  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  28.16 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.53 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.73 
 
 
225 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.51 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.58 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.88 
 
 
238 aa  77  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.92 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25.12 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.33 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.98 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 
227 aa  75.1  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.43 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  30.85 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.27 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.43 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.24 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  28.78 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.67 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.76 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  25 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.24 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.38 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.78 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.59 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.27 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.85 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  26.47 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.1 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
220 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25.85 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.06 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.48 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.62 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  27.62 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  28.25 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  25.85 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.67 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.08 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  29.05 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  28.25 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
231 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.83 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  28.25 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>