More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4195 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4195  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.164725  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4566  cyclic nucleotide-binding protein  99.57 
 
 		 234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.940335  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4711  cyclic nucleotide-binding protein  96.58 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.754309  decreased coverage  0.00295307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2874  cyclic nucleotide-binding protein  87.01 
 
 		 228 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191735 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  82.25 
 
 		 228 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  81.82 
 
 		 228 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  60.39 
 
 		 229 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.72 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  34.16 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0519  Fnr-like transcriptional activator  31.94 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  33.82 
 
 		 235 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  32.62 
 
 		 228 aa  90.1  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  35.14 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  28.5 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  28.02 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  27 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  27.54 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  27.54 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  27.54 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  25.85 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  26.7 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  26.79 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  27.54 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.4 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.21 
 
 		 212 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.23 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  27.45 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  28.57 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  32.23 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  26.57 
 
 		 210 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  72  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  25.85 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  26.57 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  25.85 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  25.85 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  25.85 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.34 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  25.37 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  24.88 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.04 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.48 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2959  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  26.09 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1132  transcriptional regulator  24.74 
 
 		 355 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.99008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  26.43 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  27.69 
 
 		 214 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  27.59 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.64 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.95 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.79 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  27.32 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.26 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>