More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1659 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  100 
 
 		 223 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  95.96 
 
 		 223 aa  421  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.02 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.65 
 
 		 240 aa  207  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.12 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  41.12 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  39.17 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.45 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.79 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.25 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.92 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.94 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.36 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  36.92 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.53 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.51 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  34.58 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.64 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  36.27 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.46 
 
 		 225 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.87 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.27 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  35.35 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.17 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.11 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.27 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.79 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.69 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 		 224 aa  105  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.76 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  35.57 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.67 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 		 224 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  32.99 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.57 
 
 		 224 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 254 aa  97.1  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 263 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  34.8 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  31.03 
 
 		 239 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.96 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.08 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 235 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 235 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 222 aa  92  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.52 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.84 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.57 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.47 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 237 aa  88.2  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.51 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 232 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0747  transcriptional regulator, putative  31.02 
 
 		 266 aa  85.5  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.59923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 238 aa  85.5  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  31.02 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  31.02 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  31.02 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  32.71 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.33 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>