More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1167 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
231 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.55 
 
 
246 aa  145  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  37.39 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  34.36 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.26 
 
 
225 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.94 
 
 
222 aa  112  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
234 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
223 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.1 
 
 
223 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.8 
 
 
235 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.8 
 
 
242 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.49 
 
 
236 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.22 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
234 aa  98.2  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.74 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.56 
 
 
240 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.77 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 
212 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.45 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  28.1 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.84 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
251 aa  78.6  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.23 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.73 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.3 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 
257 aa  72  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  25.91 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.19 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.17 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  26.87 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.19 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3029  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.63 
 
 
228 aa  68.2  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.25 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  26.9 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.54 
 
 
228 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  28.64 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.51 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.88 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.53 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  28.28 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  34.21 
 
 
857 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.61 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
227 aa  65.5  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.19 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1598  hypothetical protein  30.77 
 
 
407 aa  65.1  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.303519  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
212 aa  65.1  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.97 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  24.61 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  24.14 
 
 
236 aa  63.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  26.34 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0432  cyclic nucleotide-binding protein  39.77 
 
 
860 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.73 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
234 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.17 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
236 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
289 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 
210 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
235 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 
210 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
214 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  25 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.45 
 
 
232 aa  62  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  24.27 
 
 
224 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2565  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
235 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0695171  normal  0.0307054 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  25.27 
 
 
210 aa  62  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>