More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1773 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 263 aa  546  1e-154  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.78 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_0319  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.29 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  43.52 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  43.52 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  42.52 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  42.13 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
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NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  40.95 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
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NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 244 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 244 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.26 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.26 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.26 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.67 
 
 		 250 aa  192  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 253 aa  192  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
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NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 244 aa  191  9e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  41.26 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.03 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  41.48 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
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NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.69 
 
 		 242 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
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NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
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CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
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NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
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NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  41.59 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 247 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
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NC_011312  VSAL_I1571  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.39 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.75505  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 250 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
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NC_009832  Spro_2582  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.33 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.07 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.89 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
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NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  38.67 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1007  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.05 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.18 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  38.22 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.78 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.05 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_3775  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.26 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_2378  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 248 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2471  transcription factor Fnr  40.44 
 
 		 269 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.0435693 
 
 
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NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 239 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.66 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.66 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.66 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.66 
 
 		 250 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  37.23 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  39.22 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_1207  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2772  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00275745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.36 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  36.29 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.61 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.8 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  35.84 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.16 
 
 		 249 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0878  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.16 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 256 aa  175  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  41.26 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  41.26 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3345  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.797997  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_1692  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.816346  normal  1 
 
 
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NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.34 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
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NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  36.36 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
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NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  34.93 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_1937  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  35.11 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
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NC_010622  Bphy_1138  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 260 aa  168  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
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NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4294  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010625  Bphy_5811  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
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NC_012857  Rpic12D_4561  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.3 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.291712 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4428  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.3 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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