226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0632 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
236 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.49 
 
 
231 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
235 aa  75.5  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.17 
 
 
223 aa  72  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.86 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.93 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.19 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.34 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.34 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26880  cAMP-binding protein  30.15 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.89 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.851339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
226 aa  66.6  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.16 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
227 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.12 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
246 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
235 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.57 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.57 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
225 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  22 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
228 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.7 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
229 aa  59.7  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.62 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.78 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.17 
 
 
225 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 
230 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2741  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.21 
 
 
225 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.705936 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.16 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  27.6 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.53 
 
 
225 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.9 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  29.44 
 
 
226 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
231 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.75 
 
 
225 aa  55.5  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
246 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6804  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0796  cyclic nucleotide-binding protein  21.8 
 
 
238 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  25.41 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.72 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  28.12 
 
 
227 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.15 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.78 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.75 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.85 
 
 
236 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3539  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 
857 aa  52.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0290793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  27.98 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.26 
 
 
225 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.81 
 
 
236 aa  52  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
229 aa  52.4  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
237 aa  51.6  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  31.82 
 
 
151 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  31.03 
 
 
147 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.81 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 
413 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.37 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.85 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.11 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0056  cyclic nucleotide-binding  30.5 
 
 
739 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.07 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.61 
 
 
219 aa  48.9  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.66 
 
 
232 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.59 
 
 
224 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.86 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05510  cAMP-dependent protein kinase inhibitor, putative  32.18 
 
 
482 aa  48.9  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.8 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  24.59 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>