More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6885 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
240 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  41.26 
 
 
227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.73 
 
 
246 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 
235 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.61 
 
 
223 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.31 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.81 
 
 
242 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.39 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
246 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.5 
 
 
234 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
240 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.72 
 
 
225 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.47 
 
 
222 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  29.55 
 
 
258 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.56 
 
 
231 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  30.6 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 
225 aa  94  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.87 
 
 
225 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.52 
 
 
228 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.98 
 
 
220 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  33.88 
 
 
225 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  32.8 
 
 
225 aa  89  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 
242 aa  89  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.07 
 
 
223 aa  88.6  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
228 aa  88.6  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  30.41 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  31.86 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  27.88 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.85 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.41 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
225 aa  81.6  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  29.67 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.48 
 
 
228 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0632  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
252 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.41 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.5 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.75 
 
 
228 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.15 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.35 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.16 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
247 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.9 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.41 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.42 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  25.47 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  27.27 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.41 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.21 
 
 
251 aa  72  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.35 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.29 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.93 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.96 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  26.92 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
234 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  30.35 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  32.09 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  30.05 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  25.23 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  24.5 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
211 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
210 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  24 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.75 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>