More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0890 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
235 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  67.95 
 
 
232 aa  338  2.9999999999999998e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  68.38 
 
 
234 aa  338  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  75.32 
 
 
235 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.81 
 
 
232 aa  329  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  66.96 
 
 
231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  39.81 
 
 
227 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  35.68 
 
 
231 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  39.72 
 
 
237 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
231 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.75 
 
 
227 aa  148  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.5 
 
 
227 aa  143  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  34.93 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  34.5 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.86 
 
 
223 aa  109  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  35.96 
 
 
229 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.16 
 
 
243 aa  107  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
229 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
225 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
223 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  33.49 
 
 
223 aa  105  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.45 
 
 
225 aa  104  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.23 
 
 
220 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
225 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.59 
 
 
225 aa  102  7e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
228 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 
225 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.15 
 
 
228 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  31.05 
 
 
224 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
230 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  29.55 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.45 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
258 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.6 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.68 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.83 
 
 
236 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.7 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  29.68 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.54 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.49 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.39 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.52 
 
 
228 aa  92  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
237 aa  91.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.57 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  30 
 
 
235 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  31 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.48 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.55 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
228 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.98 
 
 
251 aa  89  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  28.92 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.72 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6568  cyclic nucleotide-binding protein  30.69 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538415  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
229 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  31.31 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 
229 aa  85.5  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6767  cyclic nucleotide-binding protein  30.2 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171014  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.4 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.87 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0199  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  27.98 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
219 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.43 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
229 aa  82  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.09 
 
 
231 aa  82  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  29.17 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  29.17 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2589  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
235 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0679634  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.77 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2459  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.55 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  25.91 
 
 
250 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  27.5 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30.21 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>