More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1995 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  100 
 
 
224 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.96 
 
 
226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  69.82 
 
 
228 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  68.16 
 
 
226 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.41 
 
 
228 aa  307  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  67.71 
 
 
228 aa  304  7e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  67.26 
 
 
225 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  66.37 
 
 
226 aa  284  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.04 
 
 
225 aa  278  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.41 
 
 
242 aa  276  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  65.74 
 
 
220 aa  276  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  64.73 
 
 
224 aa  273  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  62.16 
 
 
225 aa  268  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.71 
 
 
225 aa  267  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  61.26 
 
 
225 aa  266  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  60.81 
 
 
225 aa  265  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.04 
 
 
224 aa  263  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.64 
 
 
226 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  60.36 
 
 
225 aa  261  6e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  59.19 
 
 
225 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
224 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.04 
 
 
224 aa  244  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.7 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.38 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.7 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  56.7 
 
 
224 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.7 
 
 
224 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  58.04 
 
 
224 aa  242  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.7 
 
 
224 aa  241  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
224 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.19 
 
 
225 aa  240  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  56.7 
 
 
224 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  60.27 
 
 
225 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.82 
 
 
225 aa  229  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.83 
 
 
246 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  59.39 
 
 
241 aa  227  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.23 
 
 
225 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  47.98 
 
 
236 aa  204  8e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  45.13 
 
 
239 aa  194  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  37.62 
 
 
243 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.01 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
230 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.94 
 
 
228 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.24 
 
 
236 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
226 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.18 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
226 aa  132  5e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 
223 aa  132  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
246 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.62 
 
 
226 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.15 
 
 
251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
236 aa  128  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
223 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
263 aa  128  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.6 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.17 
 
 
225 aa  126  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  38.99 
 
 
225 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
236 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  35.98 
 
 
223 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
229 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.82 
 
 
220 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.11 
 
 
229 aa  122  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.37 
 
 
236 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.12 
 
 
222 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
225 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 
243 aa  121  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
234 aa  118  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
228 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 
223 aa  118  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.87 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.66 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
250 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  35.23 
 
 
214 aa  115  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
227 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.68 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.18 
 
 
232 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
218 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
247 aa  112  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
222 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
248 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3427  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0598833  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
235 aa  109  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3035  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 
224 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.738115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>