More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2514 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2514  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
231 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  65.94 
 
 
231 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  39.79 
 
 
232 aa  150  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.57 
 
 
232 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1243  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.91 
 
 
231 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00145976  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.62 
 
 
231 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0890  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.38 
 
 
235 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.38 
 
 
235 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.2 
 
 
235 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4798  cyclic nucleotide-binding protein  31.77 
 
 
227 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0144  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.73 
 
 
227 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.993696  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1037  cyclic nucleotide-binding protein  30.53 
 
 
227 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.272663 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3761  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  32.67 
 
 
227 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0509841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4893  cyclic nucleotide-binding protein  31.52 
 
 
237 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.36 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.93 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  30.85 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  33.73 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.54 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4596  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.33 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.85 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  31 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3304  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.2 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.18 
 
 
223 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.82 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  30.41 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1835  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  31.47 
 
 
223 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1708  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.68 
 
 
229 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
225 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.06 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48784  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.04 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  30.69 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
231 aa  75.1  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.79 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.98 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5739  cyclic nucleotide-binding protein  34.74 
 
 
235 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.69 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.71 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.78 
 
 
225 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.59 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.96 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.29 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  29.38 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3301  cyclic nucleotide-binding protein  29.61 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00259627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
236 aa  72  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.04 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 
236 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3296  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.721133  normal  0.844961 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.28 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2804  cyclic nucleotide-binding protein  28.96 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  27.69 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  28.18 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.57 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0098  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.4392599999999995e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.89 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.14 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.33 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.2 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30.57 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  33 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.26 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2323  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00053006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.44 
 
 
229 aa  69.3  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.69 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>