More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1118 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  58.9 
 
 
222 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.22 
 
 
223 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  50.65 
 
 
223 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.26 
 
 
225 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  37.85 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.63 
 
 
212 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  35.98 
 
 
228 aa  122  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
246 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.98 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
226 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  35.98 
 
 
225 aa  116  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  33.76 
 
 
227 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.11 
 
 
228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.48 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.55 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.64 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.56 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.12 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.62 
 
 
242 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.91 
 
 
224 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.45 
 
 
225 aa  111  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  32.64 
 
 
225 aa  111  9e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  33.33 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.45 
 
 
220 aa  109  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.76 
 
 
226 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.58 
 
 
209 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
241 aa  105  7e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.17 
 
 
246 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.71 
 
 
226 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  32.63 
 
 
258 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.19 
 
 
246 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  29.87 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.33 
 
 
224 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.68 
 
 
220 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.81 
 
 
223 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.49 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
225 aa  99.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  33.64 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.54 
 
 
224 aa  99  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  28.95 
 
 
236 aa  98.6  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.06 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  32.06 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.54 
 
 
224 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.62 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
224 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  34.45 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.93 
 
 
225 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
226 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
229 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.58 
 
 
224 aa  93.2  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 
226 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.74 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.38 
 
 
235 aa  88.2  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28321  putative regulatory protein  31.88 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.270503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.39 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
239 aa  85.9  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
263 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.33 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.2 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  29 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5052  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.267336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  28.7 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  24.54 
 
 
243 aa  82  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3198  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
221 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.90573 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.01 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1063  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.6 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.91 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  31.94 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.71 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.25 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  25.94 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.78 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2535  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.28 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.76 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>