More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_0602 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
225 aa  437  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.5 
 
 
222 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.26 
 
 
240 aa  168  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  41.12 
 
 
223 aa  161  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.12 
 
 
223 aa  161  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1677  cyclic nucleotide-binding protein  34.56 
 
 
258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506462  normal  0.511537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.05 
 
 
226 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1232  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.32 
 
 
235 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  33.48 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.87 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  34.11 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 
226 aa  116  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2257  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.19 
 
 
234 aa  115  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000784359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.9 
 
 
220 aa  115  6e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  34.65 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0070  cyclic nucleotide-binding protein  36.24 
 
 
227 aa  114  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.376283 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.51 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.61 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 
225 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30 
 
 
225 aa  109  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4977  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.72 
 
 
234 aa  108  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.111601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.26 
 
 
231 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0781257  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.95 
 
 
228 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5506  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
246 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324567  normal  0.438631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  33.68 
 
 
224 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
225 aa  103  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.02 
 
 
225 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.2 
 
 
242 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2016  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
229 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776172  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.79 
 
 
225 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.94 
 
 
225 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 
225 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.08 
 
 
225 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.72 
 
 
209 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6844  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.86 
 
 
235 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0901192  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 
224 aa  99  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  99  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1169  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0303416  normal  0.0506186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6885  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.72 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
224 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.61 
 
 
224 aa  95.1  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.98 
 
 
223 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0120826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
222 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1608  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.83 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.64 
 
 
231 aa  92.4  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.26 
 
 
220 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2918  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
226 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172063  normal  0.392966 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  31.69 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
246 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5511  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.360617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
225 aa  89.4  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.73 
 
 
226 aa  89  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
226 aa  89  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  30.48 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2683  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.65 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.41 
 
 
223 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  29.11 
 
 
239 aa  87.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5851  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.66 
 
 
242 aa  87  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
232 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.33 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.34 
 
 
232 aa  85.1  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 
224 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  31.94 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1557  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.986178 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
229 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3957  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 
289 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7216  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.72 
 
 
246 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726682  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
257 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0837  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0916  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.18169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>