More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3800 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 225 aa  454  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  82.74 
 
 		 229 aa  368  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  74.44 
 
 		 224 aa  355  3.9999999999999996e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  73.97 
 
 		 222 aa  333  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.36 
 
 		 222 aa  321  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  47.62 
 
 		 220 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.33 
 
 		 223 aa  188  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.65 
 
 		 225 aa  135  7.000000000000001e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.78 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  32.2 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.17 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.88 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  35.68 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.02 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.19 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.88 
 
 		 226 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  35.11 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  33.51 
 
 		 215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.88 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  34.57 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.37 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  33.51 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  34.57 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  33.33 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.9 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  30.92 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  34.05 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.77 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 		 214 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 224 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  29.86 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  32.45 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  30.81 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.9 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.73 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.43 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.94 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.2 
 
 		 225 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.49 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  32.98 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.46 
 
 		 220 aa  101  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  32.98 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.67 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  30.96 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.81 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  30.05 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 249 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0602  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.628877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  30.28 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 227 aa  94.7  9e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4286  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.28 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.78 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2020  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.73 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0424227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  29.28 
 
 		 210 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  29.28 
 
 		 214 aa  92.4  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2608  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.700213  normal  0.0258786 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  28.73 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  28.73 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  28.73 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  28.73 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  27.59 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1798  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.112724  normal  0.701218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>