More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1763 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 
223 aa  442  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  53.88 
 
 
220 aa  221  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1284  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.92 
 
 
224 aa  187  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.304913  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.5 
 
 
222 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
229 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  44.76 
 
 
222 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  39.8 
 
 
214 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.42 
 
 
219 aa  148  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34 
 
 
225 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  36.71 
 
 
214 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  38.33 
 
 
214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  36.23 
 
 
215 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  36.95 
 
 
211 aa  132  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  37.09 
 
 
226 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.7 
 
 
224 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  37.98 
 
 
217 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  35.27 
 
 
214 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  35.56 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  35.56 
 
 
214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  33.67 
 
 
225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.55 
 
 
228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  35.56 
 
 
214 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2797  cAMP-regulatory protein  36.57 
 
 
198 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207531  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  35.24 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  34.38 
 
 
212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  34.5 
 
 
228 aa  126  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  34.9 
 
 
214 aa  126  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  33.68 
 
 
210 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  33.5 
 
 
225 aa  125  6e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.57 
 
 
212 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  33.16 
 
 
210 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0596  catabolite gene activator Crp  34.95 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4577  cAMP-regulatory protein  36.87 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  33.16 
 
 
210 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4779  cAMP-regulatory protein  33.89 
 
 
214 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.345439 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.52 
 
 
242 aa  123  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.5 
 
 
225 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33 
 
 
225 aa  122  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.97 
 
 
226 aa  122  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
251 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.01 
 
 
226 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  32.12 
 
 
211 aa  121  7e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.84 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0293  cAMP-regulatory protein  32.63 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  32.11 
 
 
210 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  31.58 
 
 
211 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  31.05 
 
 
211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
226 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 
243 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.18 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.81 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.65 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4219  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
219 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.408304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.31 
 
 
220 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
237 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  31.28 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0954  cAMP-regulatory protein  33.51 
 
 
216 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.74 
 
 
224 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>