More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1482 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  482  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  59.63 
 
 
229 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  57.75 
 
 
222 aa  260  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  53.99 
 
 
232 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  49.06 
 
 
223 aa  215  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  46.48 
 
 
217 aa  188  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.06 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  32.11 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.58 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  32.54 
 
 
224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 
228 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.02 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.23 
 
 
224 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 
229 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.91 
 
 
225 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
225 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.14 
 
 
220 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  31.03 
 
 
224 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
227 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.18 
 
 
236 aa  102  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.73 
 
 
225 aa  102  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
242 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.19 
 
 
225 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  30.1 
 
 
224 aa  99.8  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.38 
 
 
224 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.84 
 
 
225 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 
228 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.81 
 
 
243 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 
226 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  30.74 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.5 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.02 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
235 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  29.79 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
237 aa  95.9  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.27 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.91 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.35 
 
 
225 aa  92.4  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
231 aa  92.4  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1659  cyclic nucleotide-binding  27.75 
 
 
223 aa  92  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.834954  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 
224 aa  92  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.37 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.05 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.36 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1498  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163113  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
234 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
231 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 
267 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  30.85 
 
 
281 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 
219 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.6 
 
 
236 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0719  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
237 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0675  cyclic nucleotide-binding protein  30.15 
 
 
240 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.35129  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4388  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  29.7 
 
 
240 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0049  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.422683  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
241 aa  86.3  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.89 
 
 
231 aa  86.3  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  26.18 
 
 
211 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.13 
 
 
240 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.5 
 
 
236 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  30.77 
 
 
218 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3673  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
254 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43296  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  30.62 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.51 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
238 aa  85.5  7e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
247 aa  85.1  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.74 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.89 
 
 
223 aa  85.1  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.32 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  25.65 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>