More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0291 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
227 aa  456  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0244  CRP/FNR family transcriptional regulator  87.5 
 
 
228 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.58 
 
 
222 aa  182  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  37.5 
 
 
267 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3679  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170413  normal  0.193267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4027  cyclic nucleotide-binding protein  36.65 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.357709  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1896  cyclic nucleotide-binding protein  37.64 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.14 
 
 
228 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  34.21 
 
 
224 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.22 
 
 
225 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.48 
 
 
226 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
225 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  30.45 
 
 
225 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.36 
 
 
226 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 
251 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  30.32 
 
 
243 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
234 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.58 
 
 
226 aa  102  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.52 
 
 
226 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.59 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
243 aa  97.1  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  33.18 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
234 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.31 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.28 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.14 
 
 
242 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.09 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.37 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31 
 
 
224 aa  89.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  33.33 
 
 
236 aa  89  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
224 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.15 
 
 
224 aa  89  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
224 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.65 
 
 
224 aa  88.6  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  30.77 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.63 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2074  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.1 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
224 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.64 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  29.6 
 
 
224 aa  86.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.65 
 
 
227 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
352 aa  86.3  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.861655  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
238 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.74 
 
 
214 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
230 aa  85.5  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.57 
 
 
225 aa  85.5  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  28.25 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2833  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.8 
 
 
213 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0320601  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6723  putative cyclic-AMP receptor-like protein  30.9 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.823634  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  27.49 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.65 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.93 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 
226 aa  82  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  27.6 
 
 
224 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.5 
 
 
224 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  34.24 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  26.19 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.89 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.98 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 
238 aa  79  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 
225 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 
229 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.89 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  27.45 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
228 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
228 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  24.52 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
221 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.94 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.14 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  25.39 
 
 
221 aa  76.3  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.94 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>