More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3158 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 223 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  65.77 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.79 
 
 		 232 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.89 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 235 aa  215  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 217 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  30 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.4 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.62 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.93 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.95 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  28.02 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.14 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 225 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.6 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.4 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.5 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.87 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0979  cAMP-binding protein  31.91 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  26.84 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.44 
 
 		 219 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 225 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.62 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  27.37 
 
 		 225 aa  98.6  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.58 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36130  cAMP-binding protein  29.65 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.758224 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0303  cyclic nucleotide-binding domain protein  32.56 
 
 		 236 aa  98.2  8e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.232206 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.69 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 		 226 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0253  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.65 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 236 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.18 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0303  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.21 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 233 aa  95.1  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3071  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.7 
 
 		 224 aa  95.1  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00222127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.35 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  29.47 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3932  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571672  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1275  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.651323 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.93 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 		 225 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3499  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00506626 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  28.04 
 
 		 243 aa  89  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 225 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4994  cyclic nucleotide-binding protein  26.96 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.103725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.77 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  28.65 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3269  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3629  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  28.02 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4187  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.94 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1371  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 224 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0955358 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  29.57 
 
 		 243 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.39 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 231 aa  85.1  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.34 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1951  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 234 aa  85.1  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  27.75 
 
 		 281 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0723  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.362046  normal  0.190371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1101  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4277  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>