More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0372 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  95.56 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  95.56 
 
 		 225 aa  440  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  86.88 
 
 		 223 aa  394  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  85.97 
 
 		 223 aa  391  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  85.52 
 
 		 221 aa  392  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  83.71 
 
 		 223 aa  381  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  77.83 
 
 		 222 aa  356  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 210 aa  297  9e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  66.06 
 
 		 238 aa  295  4e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  67.59 
 
 		 222 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  65.6 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  65.14 
 
 		 244 aa  278  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  66.36 
 
 		 244 aa  277  7e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  70.2 
 
 		 244 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  69.04 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  69.04 
 
 		 243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02711  global nitrogen regulatory protein  67.74 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.99 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.57 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 225 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.09 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 254 aa  99.4  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.32 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.67 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.53 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.61 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.47 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1955  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.47 
 
 		 229 aa  94.7  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.32 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 389 aa  94.7  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 393 aa  94  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 230 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0477  Crp family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 229 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0933534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4894  transcriptional regulator, Crp family  30.61 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0770605  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0345  Crp family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.254354  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0411  transcriptional regulator, Crp family  30.1 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000553573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 222 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.12 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  28.12 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0424  transcriptional regulator, Crp family  30.1 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.27 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.57 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0352  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 229 aa  89.7  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  28.11 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.09 
 
 		 224 aa  88.2  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.93 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.62 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.6 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.62 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.51 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 251 aa  86.3  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.42 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 247 aa  84.7  9e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.72 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0783  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  29.84 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.96 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  28.57 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.84 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  28.95 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  32.4 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  28.95 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3232  cyclic nucleotide-binding protein  30.11 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  28.95 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0292  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.210312  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0505  cyclic nucleotide-binding protein  27.32 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.287437  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>