192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2491 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
393 aa  810    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  59.48 
 
 
389 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  38.21 
 
 
405 aa  256  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.07 
 
 
200 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.55 
 
 
200 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.55 
 
 
199 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.1 
 
 
218 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
211 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
208 aa  139  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 
469 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  28.26 
 
 
233 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.69 
 
 
225 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1255 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
225 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.16 
 
 
225 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.59 
 
 
195 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
197 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.57 
 
 
225 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
210 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
238 aa  86.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
705 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0435  regulatory protein, Crp  32.35 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0427117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
703 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.02 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11461  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
210 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962041 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  33.33 
 
 
243 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
243 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  31.55 
 
 
223 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
222 aa  80.9  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  30.06 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
1418 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0674  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.83 
 
 
1021 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.85 
 
 
211 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  28.07 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 
602 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  29.21 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  29.24 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
244 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3616  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
256 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.07 
 
 
254 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.04 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1750  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
239 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499959  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0140  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.63 
 
 
239 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0938698  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
575 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.92 
 
 
305 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
682 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1018  putative PAS/PAC sensor protein  40.7 
 
 
332 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.377599  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
554 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
232 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
800 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02711  global nitrogen regulatory protein  30.41 
 
 
244 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1298  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
325 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3129  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.92 
 
 
777 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.765489  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1715  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.04 
 
 
749 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3468  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.74 
 
 
745 aa  60.5  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0436703 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1839  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.29 
 
 
763 aa  60.1  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.338108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
232 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 
227 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
236 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  25.85 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0426  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.43 
 
 
202 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.86211 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.95 
 
 
236 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
673 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4941  CRP/FNR family transcriptional regulator  59.09 
 
 
45 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 
332 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
179 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1879  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
604 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.58 
 
 
236 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
234 aa  56.2  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2163  sigma54 specific transcriptional regulator with PAS/PAC sensor, Fis family  25.4 
 
 
575 aa  56.2  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.03 
 
 
231 aa  56.2  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
1115 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4612  putative PAS/PAC sensor protein  30.69 
 
 
354 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.384861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
231 aa  55.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.54 
 
 
240 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 
560 aa  55.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0328  putative PAS/PAC sensor protein  29.86 
 
 
365 aa  53.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.68 
 
 
239 aa  53.5  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2484  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.18 
 
 
202 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.67 
 
 
236 aa  52.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0872  histidine kinase  29.2 
 
 
585 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1413  putative PAS/PAC sensor protein  26 
 
 
1251 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.629832 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.67 
 
 
236 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
641 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1998  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
207 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  hitchhiker  0.00839318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.59 
 
 
236 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1742  cyclic nucleotide-binding  23.88 
 
 
251 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
313 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1247  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
327 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.977121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0779  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
434 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1487  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.12 
 
 
240 aa  50.8  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.1472  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2246  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.78 
 
 
233 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
236 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.71 
 
 
231 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>