More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3118 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
469 aa  959    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0277954  normal  0.755166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 
446 aa  237  3e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 
404 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  50.85 
 
 
443 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.43 
 
 
1363 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
602 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
691 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 
1116 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
436 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.257658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  32.9 
 
 
589 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.71 
 
 
827 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
780 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.15 
 
 
989 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
752 aa  187  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
919 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.61 
 
 
1433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
1287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
744 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
830 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
1287 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 
744 aa  183  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 
917 aa  183  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
765 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
371 aa  182  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
989 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 
1022 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.18 
 
 
1374 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  34.79 
 
 
693 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
873 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.32 
 
 
977 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.66 
 
 
1075 aa  181  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  31.81 
 
 
1683 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1266 aa  180  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
700 aa  180  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.1 
 
 
1046 aa  180  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
916 aa  179  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  41.2 
 
 
998 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
858 aa  179  8e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  42.97 
 
 
923 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.39 
 
 
1135 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 
882 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
1003 aa  177  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.86 
 
 
927 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
745 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.2 
 
 
974 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
1310 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
823 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 
1165 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 
969 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4481  sensor histidine kinase/response regulator  37.98 
 
 
982 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.31 
 
 
687 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  37.86 
 
 
1120 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2451  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.8 
 
 
846 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.91 
 
 
975 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
1203 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 
1029 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
1133 aa  174  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.16 
 
 
738 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.69 
 
 
2213 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3611  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
577 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2393  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
676 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822967 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.5 
 
 
627 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1237 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
801 aa  172  7.999999999999999e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
562 aa  172  9e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
1131 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0659  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.95 
 
 
570 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
718 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
757 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.92 
 
 
686 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  40.66 
 
 
1361 aa  172  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.78 
 
 
833 aa  171  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
902 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  39.73 
 
 
1175 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.2 
 
 
791 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.22 
 
 
929 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.52 
 
 
1070 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 
725 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.85 
 
 
1007 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  38.43 
 
 
560 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  41.56 
 
 
970 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 
1877 aa  170  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  39.51 
 
 
461 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.74 
 
 
738 aa  170  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0393x  response regulator, histidine kinase  31.19 
 
 
943 aa  170  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.621999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0909  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
876 aa  170  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.138917  normal  0.894742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
1222 aa  170  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  43.7 
 
 
835 aa  169  7e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  41.09 
 
 
778 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  39.51 
 
 
461 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03428  PAS signal transduction protein  30.23 
 
 
962 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0808  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.68 
 
 
929 aa  169  8e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 
1068 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  39.62 
 
 
937 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.1 
 
 
852 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  42.64 
 
 
853 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.91 
 
 
1158 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 
1126 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>