143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1663 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1663  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
179 aa  367  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.231367  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3366  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.51 
 
 
208 aa  154  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.698764  normal  0.804601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
197 aa  144  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.778777  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0990  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  38.55 
 
 
195 aa  139  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.596823  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2174  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.87 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2869  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.76 
 
 
211 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00060408  normal  0.537416 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1684  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.59 
 
 
206 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.24693  normal  0.330754 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0437  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family with PAS/PAC sensor  28.89 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2491  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
393 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116073 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2356  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1146  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.242619  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2484  putative Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.38 
 
 
389 aa  68.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.399715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0353  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0346  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11071  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family protein  24.58 
 
 
233 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0207  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.65 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.163925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3970  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.42 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0435  regulatory protein, Crp  30.59 
 
 
210 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0427117  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11461  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
210 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1586  cAMP family transcriptional regulator  29.17 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.406741  hitchhiker  0.00767311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0426  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.67 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.86211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.16 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2113  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.9 
 
 
313 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0115  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.24 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.2299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
222 aa  55.5  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.11 
 
 
227 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1015  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
204 aa  53.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  unclonable  0.00000000202163  unclonable  0.0000000139192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2484  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.79 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.16 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 
225 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2010  Crp family regulatory protein  29.86 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1234  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
232 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2444  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
238 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000577484  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08701  Crp family regulatory proteins  29.63 
 
 
195 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07751  Crp family regulatory proteins  28.89 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0629  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.23 
 
 
230 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000285446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
223 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08671  Crp family regulatory proteins  28.89 
 
 
195 aa  51.2  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0277995  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0814  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  35.14 
 
 
223 aa  50.1  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1697  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.56 
 
 
259 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  hitchhiker  0.0000199045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0214  cAMP family transcriptional regulator  28.86 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
244 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.25 
 
 
244 aa  49.3  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.91 
 
 
223 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.72 
 
 
244 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
232 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.72 
 
 
243 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
238 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0860  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.693979  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  34.72 
 
 
243 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2833  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.22 
 
 
213 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0320601  normal  0.661336 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08461  Crp family regulatory proteins  28.68 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.836651  hitchhiker  0.00426427 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  36.76 
 
 
222 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
210 aa  47.8  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1487  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.71 
 
 
240 aa  47.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.1472  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  33.33 
 
 
244 aa  47.8  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1574  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.255141  normal  0.0532067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4941  CRP/FNR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
45 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.26 
 
 
238 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4099  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000655046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.88 
 
 
231 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0884  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.11 
 
 
214 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.163926  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1291  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
305 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.06322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1975  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.99 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
235 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
230 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2139  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
230 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
230 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1958  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0304498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1936  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.308171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
226 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  30.67 
 
 
211 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2165  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.71 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3398  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
230 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
222 aa  45.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.25 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
249 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.67 
 
 
238 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.88 
 
 
236 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3725  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
237 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0054318  normal  0.342144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
214 aa  44.3  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1992  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.103472  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0750  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
238 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.64 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  27.16 
 
 
224 aa  43.9  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
235 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.457493  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  44.64 
 
 
228 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.38 
 
 
240 aa  43.9  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  27.63 
 
 
225 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  25.28 
 
 
212 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  21.89 
 
 
249 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01198  cyclic nucleotide-binding protein  25.58 
 
 
229 aa  43.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>