More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1746 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  48.26 
 
 		 229 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  46.86 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  47.76 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  47.76 
 
 		 230 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  47.09 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  48.4 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  49.21 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  45.5 
 
 		 231 aa  171  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 227 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  50 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  45.64 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 227 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.39 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.98 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  46.6 
 
 		 229 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.6 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  44.1 
 
 		 211 aa  151  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  43.52 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  47.18 
 
 		 224 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.89 
 
 		 228 aa  142  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.6 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.58 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 262 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 239 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.98 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.21 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  40.86 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.32 
 
 		 250 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.76 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 208 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.76 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.46 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.81 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  37.56 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.39 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  35.87 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  31.58 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.92 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.48 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 310 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 241 aa  93.2  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 236 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  91.7  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  33.51 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1163  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 630 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  39.08 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.32 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.37 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.32 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2356  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.22 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 263 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  33.16 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.55 
 
 		 250 aa  89  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 242 aa  88.6  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  32.14 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 262 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.37 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 241 aa  87.8  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.89 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.37 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1091  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.140321  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>