More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0749 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  79.75 
 
 		 242 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  36 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  35.23 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  34.72 
 
 		 230 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.8 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  34.2 
 
 		 229 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.84 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  33.68 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  32.52 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.18 
 
 		 228 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 226 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  32.12 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  32.64 
 
 		 229 aa  105  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  33.18 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.7 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.2 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  35.84 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.6 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  30.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0878  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364978  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 248 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  30 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 249 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  30.96 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 208 aa  93.2  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 239 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.9 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  92  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.02 
 
 		 229 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  29.81 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2105  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.21 
 
 		 248 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0944449  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.78 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  29.25 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.86 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  29.25 
 
 		 244 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.5 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  29.25 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2378  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1864  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.17 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.856056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2398  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.69 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 244 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2291  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1546  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  31.03 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1788  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.765276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1783  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.251439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1491  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0202312  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1845  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.918423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1673  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.349784  normal  0.0983377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1785  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 250 aa  89  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.377507  normal  0.141635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 244 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.3 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1853  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.42 
 
 		 250 aa  88.6  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.755428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.37 
 
 		 250 aa  88.2  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.86 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  29 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.27 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4495  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  29.25 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2582  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.43 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2162  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.914647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2209  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00613295  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000942023  normal  0.178468 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  31.72 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2212  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.77 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.17 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.04 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  28.3 
 
 		 244 aa  87  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.64 
 
 		 250 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  27.36 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28 
 
 		 248 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>