More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1302 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  87.15 
 
 		 250 aa  431  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  86.75 
 
 		 250 aa  428  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  71.61 
 
 		 245 aa  327  9e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  67.66 
 
 		 246 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  55.51 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.89 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  56.89 
 
 		 238 aa  251  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 239 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.47 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  51.6 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.35 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 310 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  45.54 
 
 		 251 aa  161  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.2 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  36.27 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.75 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 242 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.14 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  39.71 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 231 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 248 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 204 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.54 
 
 		 247 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.63 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  41.32 
 
 		 229 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.48 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.32 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2061  Crp family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00300081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  45 
 
 		 230 aa  116  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  29.39 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.87 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.64 
 
 		 228 aa  113  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  38.46 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  39.02 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  38.71 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.56 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0606  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149995 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  39.62 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1334  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0164  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.13 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1016  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  39.02 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2604  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0190  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  39.49 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2747  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225266  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  39.52 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  38.95 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  38.82 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.91 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  39.13 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  30.14 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  39.13 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  32.03 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 244 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.29 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  31.25 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  31.25 
 
 		 244 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4280  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0900166 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0129  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1636  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1554  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.07 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 403 aa  102  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3812  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 257 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.279241  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6195  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.295507 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  39.88 
 
 		 211 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>