More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0576 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  52.53 
 
 
230 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  41.85 
 
 
211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
262 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.89 
 
 
239 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  41.38 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.37 
 
 
246 aa  123  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.48 
 
 
222 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
253 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.65 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.62 
 
 
234 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
220 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.74 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  37.31 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.91 
 
 
230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  40.34 
 
 
229 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.58 
 
 
227 aa  112  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  34.53 
 
 
230 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  39.2 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  35.35 
 
 
251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.11 
 
 
237 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 
250 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  37.43 
 
 
229 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.9 
 
 
254 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  36.56 
 
 
224 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
242 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  34.69 
 
 
241 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  35.36 
 
 
215 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  37.43 
 
 
229 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
236 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  41.56 
 
 
230 aa  106  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.33 
 
 
242 aa  105  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  36.36 
 
 
229 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
227 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.96 
 
 
247 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  33.85 
 
 
249 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  38.38 
 
 
231 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.38 
 
 
250 aa  102  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  37.57 
 
 
229 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.57 
 
 
229 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
244 aa  102  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
242 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.65 
 
 
243 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  36.26 
 
 
211 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.57 
 
 
240 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  34.74 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.04 
 
 
240 aa  98.6  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  30.73 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.98 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  33.5 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
242 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.61 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.91 
 
 
256 aa  95.1  8e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  30 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.2 
 
 
228 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.56 
 
 
252 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
253 aa  93.6  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  31.31 
 
 
248 aa  93.2  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1991  transcriptional activator Anr  30.57 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19910  Fnr-like negative transcriptional regulator of CydAB  30.48 
 
 
244 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
232 aa  92  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  33.71 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  29.67 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  29.67 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.23 
 
 
229 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1047  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  31.91 
 
 
247 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.86 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1258  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
241 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2085  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
264 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1530  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
239 aa  88.6  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2034  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.35 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.49 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0792  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.82 
 
 
262 aa  87.8  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.49 
 
 
242 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2782  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
262 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0680307  normal  0.414614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4991  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
221 aa  87  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1799  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.65 
 
 
250 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.417815  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.38 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>