More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0870 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  100 
 
 		 227 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  69.43 
 
 		 229 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  64.62 
 
 		 230 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  68.91 
 
 		 229 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  66.18 
 
 		 229 aa  267  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  67.36 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  62.94 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  64.25 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  64.57 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  50.5 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  50.5 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  44.64 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  52.66 
 
 		 228 aa  184  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  55.9 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.8 
 
 		 227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  41.94 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  46.41 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 236 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  54.05 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  41.71 
 
 		 224 aa  145  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.85 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  43.46 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.4 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  43.03 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 237 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.25 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.86 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.15 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.15 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  39.62 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 310 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.99 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.75 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0931  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.09 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  34.33 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.62 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2219  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  31.09 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1773  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.05 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2222  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.61 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0665535  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.53 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  36.72 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1045  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.18077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7770  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  36.84 
 
 		 256 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  33.15 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1111  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.33 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700786  normal  0.531022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 232 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.44 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.47 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1283  putative fumarate and nitrate reduction regulatory transcription regulator protein  31.9 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0516193  normal  0.32826 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02295  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.68 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003475  fumarate and nitrate reduction regulatory protein  30.68 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.292896  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  32.18 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1204  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.9 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1571  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.75505  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.68 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.68 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 244 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  28.95 
 
 		 250 aa  98.6  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  34.57 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  29.53 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  98.2  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  29.53 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2081  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2582  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.55 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1833  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2037  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441781 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1944  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.755264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1981  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2293  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  29.02 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2311  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.05 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.144598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  31.55 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1575  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1288  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.68 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1170  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 274 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1450  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  30.05 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>