253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7770 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7770  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  54.08 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7767  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  54.61 
 
 		 153 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0621624  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  36.84 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  36.52 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  35.39 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  35 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  34.83 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  34.66 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 204 aa  94.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  35 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  31.89 
 
 		 211 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.15 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  34.15 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  35.56 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  29.27 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.34 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  31.05 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.13 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  31.55 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 235 aa  72  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.19 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.22 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  28.57 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.82 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  29.82 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.02 
 
 		 250 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.48 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  25.64 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  29.17 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1666  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.78 
 
 		 250 aa  62  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0506299  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.26 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  25.26 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3034  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.369454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4521  Crp/Fnr family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0161618  normal  0.0108643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2233  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0375344  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.57 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0031  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2471  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185946  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.284481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1184  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2462  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0261424  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1464  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.855917  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3233  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.22 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4486  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5122  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3149  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5008  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5737  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.8 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0035  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 236 aa  57  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0037  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0051  cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases  27.37 
 
 		 251 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  27.49 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1540  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 630 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18142  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3138  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  24.08 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2615  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00240538  normal  0.855877 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5297  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.68 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.87 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  31.87 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4644  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2417  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.86 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0646393  decreased coverage  0.000000159166 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>