282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7766 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7766  nitrogen fixation regulation protein fixK  100 
 
 		 235 aa  494  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.701843  normal  0.257497 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7770  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  54.08 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209002  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7767  putative nitrogen fixation regulation protein fixK  68.53 
 
 		 153 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0621624  normal  0.228605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4729  transcriptional regulator FixK  37.78 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4055  transcriptional regulator FixK  37.36 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1361  transcriptional regulator FixK  36.93 
 
 		 229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0646149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1340  transcriptional regulator FixK  36.36 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2786  transcriptional regulator FixK  36.21 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0460697  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0870  transcriptional regulator FixK  36.72 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1951  transcriptional regulator FixK  34.09 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1036  transcriptional regulator FixK  32.97 
 
 		 231 aa  102  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2975  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169439  normal  0.307783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6270  transcriptional regulator FixK  33.71 
 
 		 211 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.967473  normal  0.128199 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4871  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.06 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2457  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.325923  normal  0.600278 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4375  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 268 aa  95.1  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1823  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.46 
 
 		 234 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0333657 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0408  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.191538  hitchhiker  0.00387918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5386  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.57 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3266  cyclic nucleotide-binding  32.04 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0629  transcriptional regulator FixK  30 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.595222  normal  0.236212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2220  transcriptional regulator FixK  32.54 
 
 		 224 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3277  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6927  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.422372 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0192  CRP family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 230 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5184  transcriptional regulator FixK  32.72 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.639909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3505  regulatory protein Crp  27.83 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3812  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.83 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4039  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1746  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.753218  normal  0.546792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0946  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1357  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3889  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.29 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1377  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6107  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_004310  BR0654  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.48838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1302  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.29 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0109091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1631  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.41 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0422  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.32 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.99 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.99 
 
 		 238 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1273  cAMP-binding protein  32.68 
 
 		 243 aa  72  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1357  cyclic nucleotide-binding  32.32 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.395788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6132  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0884478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0647  nitrogen fixation regulation protein fixk  28.82 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.774151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2634  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1557  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.71 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00717235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0749  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.887641  normal  0.079497 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4644  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.739127  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1147  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.74 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1217  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  28.74 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3927  Crp/FNR family transcriptional regulator  30 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.729399  hitchhiker  0.00211875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2026  transcriptional activator Crp family  26.55 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3214  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.939046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2699  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.276502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.76 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.49 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  28.49 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.91 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1752  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.11 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2581  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.658135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 232 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.41 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.17 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0588975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1464  transcriptional activator Anr  22.51 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4991  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2085  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6164  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.25 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257657  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.39 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.79 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.42 
 
 		 230 aa  54.3  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3552  regulatory protein Crp  25.77 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1984  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.54 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.312779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  27.08 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  25.28 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2378  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  24.86 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2279  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0698  Crp-Fnr regulatory protein (FnrL)  23.37 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3858  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2353  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.139893 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.74 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0460  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0532  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.283437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>