More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5361 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 299 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  99 
 
 		 317 aa  595  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  86.53 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.75 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  49.57 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.73 
 
 		 384 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 263 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  48.05 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.11 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  48.05 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  48.05 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.75 
 
 		 249 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47.18 
 
 		 255 aa  185  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.72 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  43.78 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  42.62 
 
 		 244 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.62 
 
 		 244 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.17 
 
 		 247 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  42.31 
 
 		 281 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.35 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.36 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  42.74 
 
 		 236 aa  165  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.29 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  37.65 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.65 
 
 		 259 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.8 
 
 		 244 aa  162  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.43 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.11 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.33 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.34 
 
 		 307 aa  156  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.5 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.1 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.8 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 234 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 274 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.65 
 
 		 242 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  33.91 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.06 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  37.71 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  34.33 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 243 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 243 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.06 
 
 		 245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  33.88 
 
 		 246 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.25 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.22 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 226 aa  113  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  31 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  29.86 
 
 		 276 aa  109  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.22 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 235 aa  105  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 241 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.87 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  31.74 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.39 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 252 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  31.58 
 
 		 242 aa  97.4  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 250 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 249 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 250 aa  95.9  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.15 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  31.02 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 252 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.51 
 
 		 263 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  32 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  31.19 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3568  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3322  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0702622  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 242 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4713  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.557049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.63 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5030  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3926  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>